HIFI加HIC数据组装基因组遇坑记 - 知乎 - 知乎专栏
HIFI 数据是准确率高的三代数据，不需要纠错就可以进行组装。 HIC则是基于 染色体构象捕获技术，利用 高通量测序技术......。 总之HIFI 数据可以理解为染色体片段的具体序列，而HIC数据则 …
Hi-Fi 和 Hi-C 两种用于基因组学研究的高通量测序技术 - 简书
2024年11月4日 · Hi-Fi 测序 是由PacBio（Pacific Biosciences）开发的 高保真长读长测序技术，基于SMRT（Single Molecule Real-Time）测序平台。 Hi-C 是一种用于 研究染色体三维结 …
生信人的一天~HIFI数据+HIC数据组装基因组 - CSDN博客
2022年8月1日 · 博主分享了使用HIFIASM和Juicer进行基因组组装的经历，从HIFI与HIC数据的初步理解到利用HIFASM得到contig文件，再到使用Juicer处理中遇到的挑战，包括酶切位点文件 …
李恒三代组装神器hifasm最全面介绍 - 知乎 - 知乎专栏
Hifiasm 是一种快速的单倍型重构de novo 组装软件，最初设计用于 PacBio HiFi read。 其最新版本可以利用超长的Oxford Nanopore数据来支持端到端（T2T）组装。 Hifiasm结合了HiFi、超 …
hifiasm对HiFi PacBio进行组装 - 简书
2021年8月16日 · hifiasm是一个能有效利用PacBio HiFi测序技术，在分型组装图(pahsed assembly gprah)中可靠的表示单倍体信息的算法。 流程介绍 hifiasm的分析流程如下，主要分为3个阶段
canu/hifiasm进行HIFI数据初步组装示例 - 知乎 - 知乎专栏
这是你第一次使用 **HIFI数据** 进行基因组组装，如果你想学习如何使用canu和hifiasm对基因组进行初步组装, 可以仔细阅读这篇文章，了解一下这两个…
程序员 - 用Hifiasm组装基因组：（四）用Hifiasm软件组装基因组 …
2024年6月25日 · 旧的HiFi reads可能在两端包含短的接头（adapter）序列。 可以用-z20参数修剪掉reads两端的20bp序列。 对于小的基因组，可以使用-f0参数禁止初始过滤步骤（initial …
用Hifiasm组装基因组：（三）Hifiasm软件组装基因组的多种模式_h…
2024年6月22日 · HiFi测序（High-Fidelity Sequencing）是一种由PacBio公司开发的先进DNA测序技术，基于其单分子实时测序（SMRT, Single Molecule Real-Time Sequencing）平台。高质 …
hifi+hic组装基因组 - 简书
2023年11月15日 · hifiasm大概是目前为止支持PacBio HiFi数据组装的所有软件中表现最优异的软件了。它不但能输出prim...
canu/hifiasm进行HIFI数据初步组装示例 - CSDN博客
2023年4月13日 · HiFi reads（High Fidelity reads）是2019年由PacBio公司推出的基于环化一致性序列（Circular Consensus Sequencing，CCS）模式产生的既兼顾长读长（10-20kb的长度） …