HMMER
HMMER is used for searching sequence databases for sequence homologs, and for making sequence alignments. It implements methods using probabilistic models called profile hidden …
Hmmer安装与使用-Hmmer-3.3.2（bioinfomatics tools-009）
2024年3月8日 · HMMER用于搜索序列 数据库 以查找序列同源物，并进行序列比对。 它实现了使用概率模型称为Profile Hidden Markov Models（profile HMMs）的方法。 HMMER通常 …
HMMER: biological sequence analysis using profile HMMs
HMMER searches biological sequence databases for homologous sequences, using either single sequences or multiple sequence alignments as queries. HMMER implements a technology …
HMMER3.1使用 - 简书
2018年2月7日 · HMMER3.1官方下载地址：http://hmmer.org/download.html。 HMMER3.1使用手册：http://eddylab.org/software/hmmer3/3.1b2/Userguide.pdf。 # 直接下载匹配OS的二进制 …
HMMER 官方文档学习笔记系列——HMMER 简介及安装 - 绿猫鸮 …
2021年8月21日 · hmmer 可用于进行灵敏的同源搜索、蛋白结构域的自动注释、深度多重比较数据集的管理等领域。此外 hmmer 3 不仅仅适用于多个比对，也适用于单序列比较。两两序列比 …
hmmer 简明教程 - 简书
HMMER is used for searching sequence databases for sequence homologs, and for making sequence alignments. It implements methods using probabilistic models called profile hidden …
利用 hmmer 构建隐马尔可夫模型并寻找同源基因 - 知乎
简单来说，就是通过已知的同源基因序列，在算法中进行机器学习后生成一个隐马尔可夫模型，然后我们可以利用这个模型来预测其他物种中是否存在这样的同源基因序列。 这样的隐马尔可 …
Windows环境下HMMER 3.0下载 安装与使用 - 简书
2022年10月12日 · windows系统安装HMMER 3.0，下载地址： http://hmmer.janelia.org/static/binaries/hmmer3.0_windows.zip. 选中网址--右击--选择迅雷下 …
基因功能预测工具-HMMER的安装 - 知乎 - 知乎专栏
从功能基因研究的角度来讲，相关的搜索，比如从序列数据库中，找同源的序列，或者对一个新的基因功能进行鉴定，使用hmmer比使用blast有着更高的灵敏度以及更高的搜索速度，但其应 …
HMMER3鉴定基因家族成员 - 知乎 - 知乎专栏
HMM（Hidden Markov Model, 隐马尔科夫模型），是一种序列特征谱（Profile），其搜索是基于蛋白质 多序列比对 结果中的保守序列区域进行检索，并考虑了不同保守度的氨基酸在相应位 …