Single-cell and bulk transcriptome sequencing identifies two …
2022年6月30日 · We defined the intrinsic epithelial axis of colorectal cancer and propose a refined ‘IMF’ classification with five subtypes, combining intrinsic epithelial subtype (I), microsatellite …
Molecular pathological classification of colorectal cancer—an …
2024年2月6日 · The single-cell intrinsic consensus molecular subtype (iCMS) classification of CRC, published in 2022, based on single-cell transcriptomes identified a transcriptomic …
北大汤神出品，必属精品：汤富酬教授最新结直肠癌研究成果 - 知乎
2024年3月21日 · 结直肠癌(crc)是一种高度异质性的肿瘤群，被分为不同的基因组、表观基因组和最近更受关注的转录组亚型。 24年3月发表在顶级期刊Cancer Discovery （IF29.1；Q1）上 …
文献解读 | 单细胞测序和Bulk测序联用细化结直肠癌分子分型 - 知乎
2022年6月30日，新加坡基因组研究所的研究团队在 Nature Genetics 上发表题为 Single-cell and bulk transcriptome sequencing identifies two epithelial tumor cell states and refines the …
单细胞和Bulk转录组测序鉴定了结直肠癌的两种肿瘤上皮细胞状态…
2023年8月9日 · 先前研究基于来自CRC的Bulk转录组确定了四种CMS亚型，其特征分别为免疫浸润、典型WNT和Myc活化、代谢失调、间充质纤维化富集，CMS亚型已在多项研究中重现。 …
Identification of two intrinsic epithelial subtypes of colorectal ...
2022年7月7日 · Our study identified a central epithelial backbone of colorectal cancer, iCMS2 and iCMS3, each characterized by distinct copy number genetics, transcriptional profiles and gene …
CRCrepository/iCMS.SSC - GitHub
The single-sample classifier (SSC) estimates the most probable intrinsic consensus molecular subtype (iCMS) of a colorectal cancer sample as described in Joanito et al. (Nat Genet. 2022 …
RNA-Seq-Based Molecular Classification Analyses in Colorectal …
Colorectal cancers (CRC) are classified into consensus molecular subtypes (CMS) based on gene expression profiles. The revised classification system iCMS was proposed by considering …
单细胞测序肿瘤分析学习 - 知乎 - 知乎专栏
2023年5月16日 · 结直肠癌（crc）是一种异质性疾病。 2015年，基于来自块状肿瘤的 基因表达谱 ，一个国际联盟确定了四种CMS（CMS1-4）。 其特征分别为免疫浸润，典型WNT和Myc活 …
基于 RNA-Seq 的结直肠癌和同步腺瘤分子分类分析。,Cancers - X …
2023年10月4日 · 本研究旨在通过使用 icms 检查 crc 和同步腺瘤，为腺瘤-癌序列概念提供分子证据。 使用 CiberSortx 估计上皮 CMS 细胞比例，这是一种计算机细胞分级分离方法，其中包 …
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