
蛋白结构预测 | 内在无序区域(IDR)相变预测 - 知乎
然而,近50年的研究中,有一种没有特定三维结构的蛋白不断被研究人员发现,由于这类蛋白 无法折叠成稳定的三维结构 而称为 固有无序蛋白 (intrinsically disordered regions,IDRs)。 这类蛋白虽然缺乏稳定结构且 高度可变。 IDRs的存在,使得蛋白更 容易形成液滴状,诱发相变 生成和调控的发生。 一言以蔽之: 类朊病毒无序区,是蛋白具有发生相变能力的前提。
引起相变的无序结构域(IDRs)怎么预测?跟踪热点,提升文章档 …
IDRs在调节转录、翻译、细胞信号转导、蛋白质磷酸化、小分子存储,以及对大的多蛋白复合体 (如细菌鞭毛及核糖体)自组装的调控等各方面都发挥着重要作用。 如我们熟知的DNA结合转录因子 (TF),其激活结构域 (activation domain, AD)中便包含了固有无序化的低复杂序列结构域,在真核生物基因转录阶段起着至关重要的作用。 在真核生物中,大约有三分之一的蛋白已被鉴定包括长度超过30个残基的无序区域,且有75%的哺乳动物信号蛋白存在无序区域。 同时IDRs也是许多 …
蛋白质固有无序区域预测 - 在线工具 - 纽普生物 - NovoPro
但近50多年来,研究人员不断地发现一类新的蛋白质,它们没有明确的三维结构却具有特定生物学功能,具有无序区域的蛋白称为固有无序蛋白(IDPs)或者固有无序蛋白区域(IDRs)。 无序蛋白中的无序区域由于缺少与其它蛋白,配体或细胞内环境的相互作用,因此无法折叠成稳定的三维结构。 尤其是最近相变频繁登上CNS主刊,越来越多认识到IDRs在相变中的重要作用。 IDRs的存在,使得蛋白更容易形成液滴状,诱发相变生成和调控的发生。 预测固有无序蛋白区域对于 …
Phase seperation 的无序结构域(IDRs)怎么预测? - CSDN博客
2018年11月15日 · IDRs在调节转录、翻译、细胞信号转导、蛋白质磷酸化、小分子存储,以及对大的多蛋白复合体 (如细菌鞭毛及核糖体)自组装的调控等各方面都发挥着重要作用。 如我们熟知的DNA结合转录因子 (TF),其激活结构域 (activation domain, AD)中便包含了固有无序化的低复杂序列结构域,在真核生物基因转录阶段起着至关重要的作用。 在真核生物中,大约有三分之一的蛋白已被鉴定包括长度超过30个残基的无序区域,且有75%的哺乳动物信号蛋白存在无序区域。 …
生命学院方晓峰与邓海腾合作鉴定植物中具有相分离潜力的蛋白质
2022年11月29日 · 蛋白的固有无序区(Intrinsically disordered region, IDR)又被称为低复杂度结构域(low complexity domain, LCD),通常富含特定的氨基酸残基,例如极性、芳香族和/或带电氨基酸,具有高度的构象灵活性,易于提供分子间/分子内多价的弱相互作用,是驱动蛋白相分离的 …
Intrinsically disordered regions (IDRs): A vague and ... - Cell Press
2024年4月4日 · The term “intrinsically disordered region” (IDR) in proteins has been used in numerous publications. However, most proteins contain IDRs, the term refers to very different types of structures and functions, and many IDRs become structured upon …
恰如其分,过犹不及!蛋白低复杂度无序区致病突变的分子动态
2022年7月6日 · 蛋白低复杂度结构域 (low complexity domain, LCD)在生物体内广泛存在,因未能在正常生理状态下形成稳定的三维结构而一直被认为处于无结构状态,是 固有无序域 (intrinsically disordered region, IDR)。 但LCD具有重要的生物学功能,例如形成核孔的中央选择性渗透性屏障;帮助中间纤维细胞骨架正确组装;通过其相分离或相变功能参与各种生物学功能特异的 无膜细胞器 (membraneless organelle, MLO)或生物分子凝聚体(biomolecular …
Intrinsically disordered regions are poised to act as sensors of ...
2023年8月30日 · Here, we argue that IDRs are ideally poised to act as sensors and actuators of cellular physicochemistry. We review the physical principles that underlie IDR sensitivity, the molecular mechanisms that translate this sensitivity to function, and recent studies where environmental sensing by IDRs may play a key role in their downstream function.
Protein Condensate Formation via Controlled Multimerization of ...
2022年8月2日 · In this work, we characterized sets of short, heterodimeric coiled-coil modules to promote the multivalency of a model IDR, the Arg/Gly-rich RGG domain of C. elegans P granule protein LAF-1 and regulate protein condensation in vitro and in live cells. We chose the LAF-1 RGG IDR which has been used to engineer synthetic condensates and whose ...
Molecular Cell|转录因子的内在无序区(IDR)指导其体内结合特 …
IDRs指导TF结合特异性DNA经历两步:1)IDR将TF定位至精确结合位点周围的宽泛DNA区域;2)DBD识别高亲和力motif。 这一策略加速了TF搜寻过程,反映了体内TFs对于激活信号的迅速反应。