
ImageJ分析免疫组化图片(Average Density,AOD) – 王进的个 …
2022年1月25日 · 免疫组织化学(Immunohistochemistry,IHC)是利用抗原与抗体特异性结合的原理,通过化学反应使标记抗体的显色剂显色来确定组织细胞内抗原(多肽和蛋白质),对组织切片或细胞标本中的某些多肽和蛋白质等大分子物质进行原位定性、定位或定量研究的实验技术。
Image J 统计免疫组化片子阳性信号的平均光密度值教程 - 知乎
2、 将灰度值转换为OD值: Analyze -> Calibrate Area -> Uncalibrate OD (滚动条拉到最底) -> OK。 OD值单位为Intensity(a.u.)= Intensity arbitrayr unit,即任意单位。 3、 设置测量参数: Analyze -> Set Measurements, 勾选Area,Integrated density,Limit to threshold。 4、 选择阳性区域: Adjust -> Threshold -> Auto -> Set -> OK(红色代表选中,选择Limit to threshold只计算红色选择的面积)。 5、 计算结果: Analyze -> Measure(快捷键Ctrl+M)。
一文讲清免疫组化结果到底该选择阳性面积占比,平均光密度值, …
如果RGB Stack不能很好地分离蓝色的苏木素和棕色的DAB,则可以尝试ImageJ的内置插件 IHC Toolbox (没有的可以去官网下载 Immunohistochemistry (IHC) Image Analysis Toolbox),用以剔除苏木素的颜色,教程如下: 如果 阳性信号只有深浅之分,无分布面积之分,则选择平均光密度值(Mean optiondensity,MOD);然后按此教操作 Image J 统计免疫组化片子阳性信号的平均光密度值教程。 如果 阳性信号无深浅之分,仅有分布面积变化,则可选择阳性面积占比;然 …
组化片子如何利用Image J 进行阳性信号面积占比统计分析 - 知乎
在弹出的测量参数设置选项框中,勾选需要的测量参数:Area(所框选区域面积);Mean(框选区域平均灰度值);IntDen(Integrated Density)(框选区域荧光总强度);Area fraction(面积占比),Mean gray value(平均灰度值),Limited to threshold(限于设定阈值),Display label(显示图片名称),点击OK确认。 第五步:测量参数:Analyze→Measure(快捷键 Ctrl + M) 本图片的阳性面积占比为24.626%。 第六步:保存结果:File→Save As. 导出的数据格式 …
轻松学会,用Image J定量分析免疫组化图! - 哔哩哔哩
IOD值与目的蛋白的总量成正比,IOD值除以目的蛋白分布区域面积(IntDen/Area),得到平均光密度值。 AOD(AverageOptical Density),通过AOD值作统计图,即可比较蛋白表达量的差异。 % Area即为我们所需的结果。 江苏赛尔普生物专注于为生命科学工作者提供实验技术服务。 包括流式实验、单细胞测序、蛋白芯片、iPSC重编程以及常规免疫检测等。 公司位于苏州中丹生态生命科学产业园,期待与您的合作。 网页链接 绝密! 2023年国自然立项清单表可下载(生命科 …
解忧小工具|用Image-Pro Plus进行免疫组化分析(平均光密度 …
2024年7月9日 · 累积光密度(IOD),就是把图片上每个棕色点的光密度值全部累加起来得到的值。 平均光密度(Mean density)就是用IOD除以有效目标分布区域的面积(Area)所得到的值。 即平均光密度=IOD值/Area值. 免疫组化照片主要是比较组别间(e.g.癌和癌旁、用药前和用药后)平均光密度的大小。 2.实操展示. 计算平均光密度最常用的图像分析软件:Image-Pro Plus(术业有专攻,下载问度娘哈)。 (1)首先,我们在软件里打开一张免疫组化照片。 (2)选择下图 …
使用ImageJ进行免疫组化分析 – 听水观沙
ImageJ处理免疫组化图片要额外安装插件,目前常用的两个插件有IHC Toolbox和IHC profiler。 博主看了一下IHC profiler相关内容,这个插件主要是对阳性区域进行评分并最终进行定性分析(阳性还是阴性,事实上博主并未亲自实践过),而IHC Toolbox可以出类似IPP的平均光 ...
Image J脚本批量定量免疫组化图片 - 王进的个人网站
2022年3月15日 · 程序将自动运行计算文件夹下所有图片的Area和IntDen值。 转载自:解螺旋·临床医生科研成长平台 免疫组织化学 … 继续阅读.
imageJ做免疫组化定量分析 - 简书
***在菜单栏里选择文件打开,打开实验数据图片(此处所使用图片来自互联网,大家可用自己的数据实战);然后在 plugins 菜单下 → 选择 IHC Toolbox,打开如下:
免疫组化 h-score和平均光密度aod - 百度文库
免疫组化 h-score和平均光密度aod-AOD的测定结果可以直观地反映出组织中某种蛋白质的表达水平,与H-score相比,AOD更偏重于定量分析,能够提供更加精细的数据。