
植物代谢通路注释+基因表达可视化神器--Mapman - 简书
2020年2月29日 · Mapman是一个针对植物,对基因在生物体代谢途径和生物过程中的功能进行分类的工具,它采用了层次分类的方式,对基因产物进行功能分类,目前涉及的通路分类等主要是36个BINs(可以理解为36个大类),其下分为subBINs,而且这些通路基本上都是通过人工检验过 ...
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Welcome to the MapMan Site of Analysis . MapMan Application Software ()Robin and RobiNA Omics Preprocessor Software ()Mercator Automated Sequence Annotation Pipeline ()PageMan Multiparallel Experiment Analysis (go ->)Xeml: Document your experiments ()
Tutorial - MapMan - GabiPD
Mercator is a tool to batch classify protein or gene sequences into MapMan functional plant categories. Many MapMan categories deal with metabolic pathways and enzyme functions, therefore using this pipeline a draft metabolic network can be established, especially after manual corretion of the automatically derived classification see e.g. May ...
植物代谢通路注释+基因表达可视化神器--Mapman - 组学大讲堂 …
Mapman是一个针对 植物 , 对基因在生物体代谢途径和生物过程中的功能进行分类的工具, 它采用了层次分类的方式,对基因产物进行功能分类,目前涉及的通路分类等主要是 36个BINs (可以理解为36个大类),其下分为subBINs,而且这些通路基本上都是通过人工 ...
Mapman-完全上手指南-Part_2(Mapman系列之四) - 简书
2018年3月6日 · 在上一篇推送中,具体介绍了Mapman三个主要的数据信息,其中有两个从某种程度来说 必须是自己准备的。 既然数据准备好,那么本推就主要 介绍数据的导入和基本的操作 ,或者说 可视化 。
Major CHO metabolism overview category of MapMan showing …
Here, we report the proteome profiles of mature Super-hongmi and Super-jami seeds, and compared them with the Hopum (white seeds) using a label-free quantitative proteomics approach. This approach...
Mapman使用教程(挺保姆了)22/8/2更新一下别人做的教程 - 知乎
Mapman出图需要三个文件: 1. 通路底图文件 (从它的网站上下载,底图是两个文件一套。) 2. 基因背景文件 (我这么理解的,需要自己做。) 3. 基因前景文件 (包含基因ID和你要使用的数值)
Mapman完全上手指南-Part_1(Mapman系列之三) / 开普饭
2024年4月27日 · Mapman里面,双击Mapping,选择一个数据,双击多次就可以看到,Mapman BIN的层级组织形式,其中最后有三个转录本对应到10.1的BIN编号。 这个是很久很久以前拟南芥某款芯片对应的探针ID,一个探针相当于现在一个转录本。
MapMan 使用教程 - 知乎 - 知乎专栏
MapMan 是一款基于 Gene Ontology 的组学分析软件。软件分析的过程简单来说就是通过对比客户(customer)提供的Gene list 中给定的Genes 与已经构建好的Mapping文件,并将Gene list 中所带的值可视化出来,是一款将RNA或者DNA-seq结果可视化的分析软件。
植物老牌注释神器—mapman - 简书
2018年3月22日 · 植物老牌注释神器—mapman. 昨晚看TBtools作者CJ的简书老激动了,眼下就想做两件事:一是对TBtools使用的梳理和新功能的挖掘,比如多物种共线性可视化什么的。由于我最早就是用TBtools做的GO和KEGG富集(需要输入基因组注释文件,我自己用interpro做的。
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