系综是指大量性质和结构完全相同的、处于各种运动状态的、各自独立的系统的集合。 在lammps模拟中，常用的系综有nve、nvt、npt三种系综，下面说说这三种系综的使用方法。 1. nve（微正则系综）nve系综保证系统中原…

2021年4月24日 · 我看gromacs教程的一般流程都是：能量最小化，NVT控温，NPT控压，最后进行一个比较长的恒温恒压的成品模拟，我就很疑惑，既然最后都进行比较长的成品模拟了，为啥么还要之 ...,计算化学公社

微正则系综 (micro-canonical ensemble)，简写为 NVE ，表示具有确定的粒子数 (N)、体积 (V)、能量 (E)。 广泛应用于分子动力学模拟中，是孤立、保守的统计系综。 2. 正则系综 (NVT) 正则系综 (canonical ensemble)，简写为NVT，表示具有确定的粒子数 (N)、体积 (V)、温度 (T)。 正则系综是蒙特卡罗方法模拟处理的典型代表。 3. 等温等压系综 (NPT) 等温等压系综 (constant-pressure, constant-temperature)，简写为NPT，表示具有确定的粒子数 (N)、压强 (P)、温度 (T)。 4. 等 …

2025年3月16日 · 和nvt一样，npt系综通过调节原子速度调控温度，不同的是，npt系综下box的尺寸可以发生变化。nvt和npt系综也可以配合使用，比如，对于比较复杂的模型，可以先进行nvt系综下弛豫，然后再进行npt系综下的弛豫。

2022年10月7日 · 在lammps模拟中，常用的系综有nve、nvt、npt三种系综，下面说说这三种系综的使用方法。 1. nve（微正则系综） nve系综保证系统中原子数量n、体系总体积v和体系总能量e保持不变。

正则系综 （canonical ensemble），全称应为“宏观正则系综”，简写为NVT，即表示具有确定的粒子数（N）、体积（V）、温度（T）。 正则系综是 蒙特卡罗方法 模拟处理的典型代表。

2022年7月25日 · Learn about the various ensembles such as NVE, NVT, NPT and their application in MD simulations. Understand how they impact the thermodynamic properties of the biomolecular system, and how to implement them in your MD simulation using GROMACS.

2016年3月2日 · 不管是nvt还是npt模拟，都有个预平衡阶段，对于生物大分子体系一般看rmsd是否收敛，对于小分子溶液体系一般看密度之类的量是否收敛，收敛之后的轨迹都可以用来分析统计。

在大多数模拟中，用nvt或者npt都可以。 以拉伸为例，使用deform进行拉伸，系综可以为nvt，也可以为npt，不过在npt下更有容易模拟泊松效应。 使用velocity方式进行拉伸，在拉伸方向只能为s边界，使用nvt系综更方便。

2018年4月15日 · 最好用nve，因为nvt/npt里的控温/控压方法可能会对轨迹产生扰动从而影响扩散行为。 如果一定要用，建议采用Nose-Hoover系列方法，一定不要用Andersen 回复 Reply