
lammps教程:nve/nvt/npt系综设置方法 - 知乎 - 知乎专栏
系综是指大量性质和结构完全相同的、处于各种运动状态的、各自独立的系统的集合。 在lammps模拟中,常用的系综有nve、nvt、npt三种系综,下面说说这三种系综的使用方法。 1. …
关于跑MD步骤的问题 - 分子模拟 (Molecular Modeling) - 计算化学 …
2021年4月24日 · 我看gromacs教程的一般流程都是:能量最小化,NVT控温,NPT控压,最后进行一个比较长的恒温恒压的成品模拟,我就很疑惑,既然最后都进行比较长的成品模拟了,为 …
分子动力学模拟常用系综 - 知乎 - 知乎专栏
微正则系综 (micro-canonical ensemble),简写为 NVE ,表示具有确定的粒子数 (N)、体积 (V)、能量 (E)。 广泛应用于分子动力学模拟中,是孤立、保守的统计系综。 2. 正则系综 (NVT) 正则 …
Gromacs模拟中的NVT,NPT分别是什么含义?一文给你讲透它..._npt …
2025年3月16日 · 和nvt一样,npt系综通过调节原子速度调控温度,不同的是,npt系综下box的尺寸可以发生变化。nvt和npt系综也可以配合使用,比如,对于比较复杂的模型,可以先进行nvt …
了解lammps中NVE/NVT/NPT三种系综的特性和区别 - CSDN博客
2022年10月7日 · 在lammps模拟中,常用的系综有nve、nvt、npt三种系综,下面说说这三种系综的使用方法。 1. nve(微正则系综) nve系综保证系统中原子数量n、体系总体积v和体系总能 …
分子动力学系综小结 - 知乎 - 知乎专栏
正则系综 (canonical ensemble),全称应为“宏观正则系综”,简写为NVT,即表示具有确定的粒子数(N)、体积(V)、温度(T)。 正则系综是 蒙特卡罗方法 模拟处理的典型代表。
Molecular Dynamics: Ensembles - Compchems
2022年7月25日 · Learn about the various ensembles such as NVE, NVT, NPT and their application in MD simulations. Understand how they impact the thermodynamic properties of …
求助NVT NPT过程的必要性 - 分子模拟 (Molecular Modeling) - 计 …
2016年3月2日 · 不管是nvt还是npt模拟,都有个预平衡阶段,对于生物大分子体系一般看rmsd是否收敛,对于小分子溶液体系一般看密度之类的量是否收敛,收敛之后的轨迹都可以用来分析统 …
了解lammps中NVE/NVT/NPT三种系综的特性和区别 - 代码先锋网
在大多数模拟中,用nvt或者npt都可以。 以拉伸为例,使用deform进行拉伸,系综可以为nvt,也可以为npt,不过在npt下更有容易模拟泊松效应。 使用velocity方式进行拉伸,在拉伸方向只能 …
NPT与NVT比较,及不同的系综计算对扩散系数值的影响? - 分子 …
2018年4月15日 · 最好用nve,因为nvt/npt里的控温/控压方法可能会对轨迹产生扰动从而影响扩散行为。 如果一定要用,建议采用Nose-Hoover系列方法,一定不要用Andersen 回复 Reply