
Hmmer安装与使用-Hmmer-3.3.2(bioinfomatics tools-009)
2024年3月8日 · Profile hidden Markov models (profile HMMs) 是一种用于序列分析的 统计模型,通常用于对生物学序列进行建模和比较,如蛋白质序列或DNA序列。 它们是隐马尔可夫模 …
使用 HMMER 进行 PFAM 注释 | 陈连福的生信博客 - chenlianfu.com
Pfam 分 A 和 B 两个数据库,其中 A 数据库是经过手工校正的高质量数据库, B 数据库虽然质量低些,依然可以用来寻找蛋白质家族的保守位点。 Pfam 最新 v27.0 版本的数据库中, A 数据 …
HMMER
HMMER is used for searching sequence databases for sequence homologs, and for making sequence alignments. It implements methods using probabilistic models called profile hidden …
比blast还优秀的序列比对工具?HMMER来了 - 知乎
HMMER是一种常用的序列比对工具,它是基于 隐马尔可夫模型 (Hidden Markov Model,HMM)的算法。 HMMER可以用于比对不同类型的生物序列,包括蛋白质序列和核酸 …
PB Swiss Tools 304-1 Recoil Combination Hammer 304-1
2014年7月31日 · With this hammer, I feel like they tried to reinvent the wheel and it just doesnt feel right to me. But as always with pb swiss, the fit and finish are perfect. Read more
- 评论数: 226
使用Hmmer寻找同源基因 - 知乎 - 知乎专栏
2023年4月15日 · 在筛选同源蛋白序列的时候,以前都是使用BLAST进行比对,这次看到很多教程都是使用HMMER进行寻找,那么也就顺便来学习一下吧。 HMMER使用并不是很难,原理 …
pfamscan 的使用_使用 HMMER 进行 PFAM 注释 - CSDN博客
2020年12月20日 · 本文介绍了如何使用 HMMER 工具进行 Pfam 数据库的蛋白质家族注释,包括 HMMER 和 Pfam 的下载安装、数据库处理以及 hmmscan 命令的使用,重点讲述了如何通过 …
Mallets & Hammers - PBTools.us
The PB Swiss Tools mallets are extremely robust and are unique in their construction: They are available with and without rebound. The wooden handles consist of FSC-certified hickory …
HMMER3鉴定基因家族成员 - 知乎 - 知乎专栏
HMM(Hidden Markov Model, 隐马尔科夫模型),是一种序列特征谱(Profile),其搜索是基于蛋白质 多序列比对 结果中的保守序列区域进行检索,并考虑了不同保守度的氨基酸在相应位 …
HMMER:基于Profile HMM的生物序列分析工具 - CSDN博客
2024年10月10日 · HMMER是一款用于生物序列数据库中搜索同源序列的开源工具。 它利用“profile hidden Markov models”(Profile HMMs)技术,能够高效地处理单序列或多序列比对查 …