At the transcriptional level, reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) displays a reliable capacity to detect anaplastic lymphoma kinase (ALK) fusion in tissue samples from patients with non-small-cell lung cancer (NSCLC).

2013年2月6日 · ALK基因全称为间变性淋巴瘤激酶（anaplastic lymphoma kinase，ALK），总共有29个外显子。 为了方便理解，各位可以将它想象成一辆名为ALK的高铁列车，而29个外显子就是列车的29节车厢，那么“融合突变”就是 指ALK的某节车厢断裂并且与其他班次的列车车厢相接变成一个新的列车，最常见的是从ALK号列车的20号车厢处断裂，并与另一辆名为“ EML4 ”的基因重新拼接，如下所示。 已发现的所有ALK基因融合突变都是在ALK基因外显子20处发生断裂， …

2018年7月17日 · 目前针对ALK融合基因检测常用的方法有三种—荧光原位杂交（FISH）、基于PCR扩增技术（RACE-PCR或RT-PCR联合测序技术、qRT-PCR等）和免疫组织化学法（IHC）。 上述三种方法各有其优缺点。 简单来说，FISH是临床试验验证的金标准方法；RT-PCR对标本取材要求较高，需专用的试剂盒进行检测，且只能检出已知的融合；IHC虽简便易行，但阳性标准不统一。 先来看看几项临床研究： 在2014年，法国的雷恩大学医学院在国际肺癌研究协作组的专 …

5 天之前 · Anaplastic lymphoma kinase (ALK) fusion-positive lung cancer represents approximately 3%–7% of NSCLC cases . ... Sichuan University, who had undergone at least one of the ALK-V, FISH, RT-PCR, and NGS tests. These cases were compiled into a comprehensive ALK database. From this database, a total of 378 patients who tested positive for all four ...

Both DNA/RNA-based NGS and RNA-based RT-PCR were used to detect EML4-ALK fusion. For samples with discordant ALK status results, fluorescence in situ hybridization (FISH) or Sanger sequencing was used to further confirm the ALK status. Results: In total, 124 samples were successfully analyzed using both NGS and RT-PCR. For 118 samples, results ...

Compared with FISH and qRT-PCR analyses, immunohistochemistry (IHC) is the preferred screening test in most pathology practices for ALK-rearrangement detection. With 100% sensitivity and 98% specificity, the VENTANA ALK (D5F3) IHC assay has been approved in the EU and some Asian countries for ALK-rearrangement detection.

目前RT-PCR和NGS用于ALK检测在增多。 本文比较4种检测检测技术。 患者来自ETOP 研究，96例患者进行FISH、RT-PCR和NGS检测，H评分>120定义为 免疫 组化阳性。 RNA提取同样来自福尔马林固定石蜡包埋标本。 对于RT-PCR，引物覆盖最常见的ALK融合类型。 研究目的分析各个检测技术的一致性。 对于NGS，在95例患者中检测出77例（81.1%），RT-PCR在96例中检测出77例（80.2%）。 4种方法分析60例患者55例表现为一致（43例ALK阴性、12例ALK阳性）。 …

肺癌中 ALK 基因突变类型为 ALK 融合突变或者称为 ALK 重排，这种突变模式与我们常见的基因点突变模式不同，比如常见的 EML4-ALK 融合突变，EML4 和 ALK 基因分别在 2 号染色体 DNA 的 p21 和 p23，两个基因相隔约 10MB 距离，这 2 个基因片段通过倒位融合形成新的融合基因 …

5 天之前 · 然而，这些特征并不是诊断alk阳性肺癌的必要条件。 （二）诊断方法. 检测alk基因重排对于治疗决策至关重要。目前，检测alk基因重排的方法包括下一代测序（ngs）、荧光原位杂交（fish）、免疫组化（ihc）和逆转录聚合酶链反应（rt-pcr）。

2014年2月2日 · In a recent study, RT-PCR detected EML4-ALK variant 1 or 3a/b in 11 of 46 cases (24%) of lung adenocarcinomas that were enriched for wild-type EGFR status. Nine of these 46 cases (20%) were tested positive for variant 1 by RT-PCR; of those 9, only 1 (11%) was unanimously positive by FISH .