RCSB Protein Data Bank (RCSB PDB) enables breakthroughs in science and education by providing access and tools for exploration, visualization, and analysis of: These data can be explored in context of external annotations providing a structural view of biology. 3D visualization for PDB structures and ligand binding sites.

蛋白质资料库 （Protein Data Bank，简称 PDB）是一个专门收录 蛋白质 及 核酸 的 三维 结构资料的数据库。 由Worldwide Protein Data Bank监管。 PDB可以经由网络免费访问，是结构生物学研究中的重要资源。 为了确保PDB资料的完备与权威，各个主要的科学杂志、基金组织会要求科学家将自己的研究成果提交给PDB。 在PDB的基础上，还发展出来若干依据不同原则对PDB结构数据进行分类的数据库，例如GO将PDB中的数据按基因进行了分类。 这些资料和数据一般是世界各 …

2022年12月29日 · PDB是目前最主要的收集生物大分子 (蛋白质、核酸和糖)2.5维（以二维的形式表示三维的数据）结构的数据库，是通过X射线单晶衍射、核磁共振、电子衍射等实验手段确定的蛋白质、多糖、核酸、病毒等生物大分子的三维结构数据库。

PDS-1000/He 基因枪系统将微米大小的、包被有核酸的金或钨微粒（ 0.6–1.6 μm ）加速到所需要的速度，从而将 基因导入细胞、组织或器官。

2018年8月16日 · PDB (Protein Data Bank)是一种标准文件格式, 其中包含原子的坐标等信息, 提交给 Protein Data Bank at the Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB) 的结构都使用这种标准格式. 这里整理网上已有的一些资料, 对PDB格式做个简短介绍.

As a member of the wwPDB, the RCSB PDB curates and annotates PDB data according to agreed upon standards. The RCSB PDB also provides a variety of tools and resources. Users can perform simple and advanced searches based on annotations relating to …

从历史上看，PDB中的结构数量大约以指数率增长，1982年有100个注册结构，1993年有1,000个结构，1999年为10,000个结构，2014年为100,000，在2023年1月为200,000 。 PDB最初使用的文件格式称为PDB文件格式。 原始格式受到 计算机打孔卡 的宽度限制，每行80个字符。 1996年左右，“大分子晶体学信息文件”格式MMCIF，它是 CIF格式 的扩展。 MMCIF成为2014年PDB档案的 …

2024年10月25日 · PDB（Protein Data Bank）是一个存储生物大分子（如蛋白质和核酸）三维结构的数据库。 它包含了通过实验方法（如X射线晶体学、核磁共振等）确定的分子结构数据。

2024年4月18日 · 在PDB文件中，这种情况以“替代位置”（alternate location）的方式记录下来（在残基名钱），各自出现的概率用占有率（occupancy）描述。 分子模拟要求清除多余的构象，仅保留一个确定的位置。 通常，我们会选择occupancy最大的那个。 2.3 蛋白封端. 当PDB文件中缺失残基时，会出现序列缺口（gap）。 对分子动力学模拟而言，不做处理很可能会导致严重的问题。 一种做法是将氨基和羧基分别处理成带电离子（NH3+和COO-），这对远离结合口袋的缺口是 …

2025年3月21日 · PDB (Protein Data Bank)是目前最主要的收集生物大分子 (蛋白质、核酸和糖)2.5维 (以二维的形式表示三维的数据)结构的数据库，是通过X射线单晶衍射、核磁共振、电子衍射等实验手段确定的蛋白质、多糖、核酸、病毒等生物大分子的三维结构数据库。