
转录组非负矩阵分解 (NMF)/一致性聚类 …
2024年8月13日 · 非负矩阵分解 (NMF)和一致性聚类(ConsensusClusterPlus)是两种常用的聚类和模式识别方法,它们在算法原理、使用场景和结果解读上都有相似和不同之处。 这两种 …
Non-negative matrix factorization - Wikipedia
Non-negative matrix factorization (NMF or NNMF), also non-negative matrix approximation[1][2] is a group of algorithms in multivariate analysis and linear algebra where a matrix V is factorized …
[R]无监督聚类-ConsensusCluster & NMF - 知乎
针对基因表达矩阵或者芯片数据,可以基于表达水平对数据进行 无监督聚类 分析。 完成这个功能的算法有很多种,如 非负矩阵分解 (nonnegative matrix factorization),一致性聚类 …
转录组非负矩阵分解 (NMF)/一致性聚类 (ConsensusClusterPlus)
2024年8月12日 · 非负矩阵分解(NMF)和一致性聚类(ConsensusClusterPlus)是两种常用的聚类和模式识别方法,它们在算法原理、使用场景和结果解读上都有相似和不同之处。
脚本更新---NMF在空间转录组的运用 - 简书
2024年12月17日 · NMF的一个主要用途是将高维的RNA-seq数据分解为低秩近似。 通过将基因表达矩阵V分解为W(基矩阵)和H(系数矩阵),可以识别出隐藏在数据中的主要模式: W代 …
2023-MutationalPatterns包学习笔记(二)-Mutational signatures之NMF
2023年10月6日 · NMF:使用非负矩阵分解 (NMF),可以从突变计数矩阵中重新提取Mutational signatures。 signature refitting:还可以确定突变计数矩阵对先前定义的Mutational signatures …
使用NMF代替层次聚类 - 生信菜鸟团
这样的感觉,其实就可以使用NMF算法来实现,尤其是层次聚类并不能很好的把样本进行“泾渭分明”的分组。 第一步:判断最佳分组
10X单细胞(10X空间转录组)数据分析之NMF(非负矩阵分解)
2021年7月27日 · 非负矩阵分解 (Non-negative Matrix Factorization, NMF)本质上说是一种矩阵分解的方法,对于任意给定的一个非负矩阵V,NMF算法能够寻找到一个非负矩阵W和一个非负矩 …
(六)单细胞数据分析——非负矩阵分解(NMF)识别功能模块_非负矩阵分解 (nmf…
2023年6月26日 · 对于细胞分群效果不理想,如上皮细胞存在异质性等,可以考虑使用非负矩阵分解(NMF)的方式去定义元程序(meta program,即功能模块)和元标签(meta label,即功 …
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