
PDBe < PISA < EMBL-EBI
PDBePISA is an interactive tool for the exploration of macromolecular interfaces. With PDBePISA, you can: Retrieve pre-calculated results for the whole PDB archive.
分子对接及结果分析在线工具 - CSDN博客
2022年9月8日 · 下载的对接结果PDB文件可以用可视化的软件打开查看如PyMOL、Chimera、Discovery Studio、Schrodinger等,或者用下面提到的在线工具PDBePISA。 PDBePISA - 对接结果分析
来一场蛋白与蛋白间的“风花雪月” - 知乎 - 知乎专栏
重点推荐 PDBePISA ( https://www. ebi.ac.uk/msd-srv/prot_ int/pistart.html ),该软件在分析大分子溶剂可及性和相互作用界面方面非常优秀,其可通过输入复合结构的RSCP PDB编号或上传对接的复合结构来进行分析,使用方法十分简单,但面对预测结果,又该如何理解呢?
蛋白互作组学系列丨(七)蛋白互作结构域的预测分析 - 哔哩哔哩
但如果主要目的是分析互作蛋白相互作用的结构域和作用面,使用pdbepisa是一种更简单直接的方法。 1) 上传上一步获得的任一互作PDB结构文件,提交分析任务。
92. 山东大学公开课:相互作用面分析PDBePISA - 网易
2019年8月23日 · 山东大学公开课:相互作用面分析pdbepisa 2019年8月23日 8489观看 本课程的主要内容包括生物信息学的概述、生物数据库的查询及搜索、核酸/蛋白质序列的比较分析、分子进化及系统发生、蛋白质结构的预测及分析、基因组学与蛋白质组学、序列算法、统计基础 ...
分子对接 - 简书
2020年6月8日 · PDBePISA 进行蛋白对接分析. 可以对分子对接比较后的结果进行分析。 可以在interface 界面下查看相关的信息 自动能结果小于零才有意义
蛋白互作结构域的预测分析 - 知乎 - 知乎专栏
①基于 PDBePISA 的蛋白相互作用面分析:在PDBePISA网页( https://www. ebi.ac.uk/msd-srv/prot_ int/cgi-bin/piserver )中上传上一步获得的任一互作PDB结构文件,提交分析任务(图6)。
PDBePISA | EMBL-EBI Training
PDBePISA allows you to explore macromolecular (protein, DNA/RNA and ligand) interfaces and predict the quaternary structure of your protein. This course will show you how to use PDBePISA and what you can do with it.
组学数据分析实操系列 | (六)蛋白相互作用域可视化分析 - 知乎
可以使用前期所讲的pdbepisa对蛋白相互作用面进行分析。 这一期我们将使用Pymol对蛋白的相互作用界面进行可视化分析。 1)分析对接结构中蛋白间相互作用
This tutorial introduces the PDBePISA (PISA for short) service, which is a web- based interactive tool offered by the PDBe to investigate stability of formation of macromolecular complexes (protein, DNA/RNA and ligand).
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