2016年8月29日 · We introduce RNA G-quadruplex sequencing (rG4-seq), a transcriptome-wide RNA G-quadruplex (rG4) profiling method that couples rG4-mediated reverse transcriptase stalling with next-generation...

2022年10月25日 · 在所有的RNA结构中，RNA G四联体（RNA G-quadruplex, rG4）是一种重要的RNA三级结构。 它通常富含鸟嘌呤（G-rich）并同时包含Hoogsteen碱基和Watson-Crick碱基。 目前，rG4被证明在转录后调控过程发挥重要作用，包括抑制翻译过程，减弱RNA降解，影响miRNA的结合以及RNA的可变剪切等【1】。 rG4具有明显的序列特征，如典型的rG4为四组三联鸟嘌呤与三个长度不超过7nt的环 （G3N1-7）。 此外，还有一些非经典的rG4结构，如二联鸟嘌 …

In this review, we will summarize the innovative high-throughput methods recently developed to detect rG4s on a transcriptome-wide scale, highlight the many novel and important functions of rG4 being discovered in vivo across the tree of life, and discuss the key biological questions to be addressed in the near future. INTRODUCTION

2021年4月1日 · RNA G-quadruplexes (RG4s) are four-stranded structures known to control gene expression mechanisms, from transcription to protein synthesis, and DNA-related processes.

2023年1月6日 · RNA G-quadruplexes (RG4s) are non-canonical, disease-associated post-transcriptional regulators of gene expression whose functions are driven by RNA-binding proteins (RBPs). Being able to explore transcriptome-wide RG4 formation and interaction with RBPs is thus paramount to understanding how they a …

2024年2月9日 · RNA G-quadruplexes (rG4s) are emerging stress-responsive cis -elements found in both the coding and noncoding transcriptomes. The dynamics of rG4s contribute to different aspects of RNA metabolism from transcription to decay. Cellular stress affects rG4s’ dynamics and the functions of rG4-bearing transcripts.

We present rG4detector, a convolutional neural network for predicting rG4 folding of any given sequence based on rG4-seq data. rG4-seq experimental protocol was employed to generate transcriptome-wide rG4 maps of human HeLa cells (accession code GSE77282).

2024年11月3日 · 近日，来自日本熊本大学的 Yasushi YabukiI 和 Norifumi Shioda 研究团队在 Cell 上发表题为 RNA G-quadruplexes form scaffolds that promote neuropathological a-synuclein aggregation 的文章， 发现RNA G四链体的组装为αSyn的累积提供支架，细胞内Ca2+可以诱导RNA G四链体组装，并促进αSyn相变和沉积，用药物抑制RNA G四链体组装可以抑制αSyn累积、神经退行以及相关运动缺陷。

2025年3月1日 · G-quadruplexes (G4s) are non-canonical nucleic acid secondary structures formed by guanine-rich DNA or RNA sequences. These structures play pivotal roles in cellular processes, including DNA replication, transcription, RNA splicing, and protein translation.

2022年10月25日 · 在所有的RNA结构中，RNA G四联体 （RNA G-quadruplex, rG4） 是一种重要的RNA三级结构。 它通常富含鸟嘌呤 （G-rich） 并同时包含Hoogsteen碱基和Watson-Crick碱基。 目前，rG4被证明在转录后调控过程发挥重要作用，包括抑制翻译过程，减弱RNA降解，影响miRNA的结合以及RNA的可变剪切等 【1】。 rG4具有明显的序列特征，如典型的rG4为四组三联鸟嘌呤与三个长度不超过7nt的环 （G3N1-7） 。 此外，还有一些非经典的rG4结构，如二联 …