4种检测正在翻译的mRNA的方法 - 知乎
RNC-Seq是在Polysome profling方法的基础上，由暨南大学张弓教授课题组采用RNC-mRNA (RNC表示Ribosome-Nascent-chain-Complex, 核糖体-新生肽链复合物)直接分离技术，使用单一浓度蔗糖溶液作为缓冲液，通过超速冷冻离心将核糖体组分与游离mRNA以及其他细胞组份分离开来。 由于所有的核糖体组分都沉淀在管底，抽提沉淀中的RNA，即可得到RNC-mRNA。 然后结合高通量测序即可获得所有正在翻译的全长mRNA信息（图2） [4]。 此项技术难点在于RNC …
Polysome profiling followed by quantitative PCR for identifying ...
2022年3月18日 · Here, we present an easy and cost-effective protocol to screen for potential micropeptide-encoding lncRNAs by polysome profiling in suspension cell lines. When combined with quantitative PCR, this protocol facilitates the identification of …
Ribo-seq核糖体印迹测序服务 - 蛋白质翻译效率|Ribo-seq …
利用Ribo-seq，研究者能从基因组水平检测蛋白质的翻译状况，获得全面的、高质量的蛋白质翻译速度情况，了解蛋白质表达情况及其丰度；还能直接对翻译过程进行研究。
翻译组学测序研究利器|Ribo-seq&Polysome-seq - 知乎
通过Ribo-seq可获得全基因组水平的蛋白翻译情况，发现新蛋白/短肽。 同时，还可以和转录组数据联合计算RNA的翻译效率，或与蛋白组的数据联合分析瞬时翻译与蛋白累积的关系，分析蛋白的降解效应等。
翻译组Ribo-seq-诺禾致源 - Novogene
核糖体印记测序 (Ribosome profiling sequencing)是指对与核糖体结合的正在翻译的RNA片段进行测序，来准确获取样本中所有可翻译分子（mRNA和其他潜在的可翻译RNA如lncRNA, circRNA等）的信息。 Ribo-seq可以研究细胞内基因翻译的区域、水平、速率等，与转录组、蛋白质组以及ncRNA测序等进行关联分析，可以揭示转录后调控网络以及识别新的蛋白质编码基因。 该技术利用蛋白酶抑制剂瞬时捕获住处于翻译过程的多聚核糖体与RNA链复合物，再通过RNA酶消化细 …
国自然热点 | 翻译组测序Ribo-seq—连接转录组和蛋白组的桥梁
翻译组测序（Ribo-seq）是指对与核糖体结合的正在翻译的RNA片段进行测序，来准确获取样本中所有可翻译分子（包括mRNA和其他潜在可翻译RNA分子如lncRNA, circRNA等）的信息与精确定量，是连接转录组与蛋白质组之间…
翻译组学测序研究利器|Ribo-seq&Polysome-seq_分析_调控_样品
2024年8月1日 · 该技术通过利用RNA酶消化细胞中的RNA，以降解除受核糖体保护的RNA片段外的所有mRNA，得到被核糖体保护的正在翻译的RNA片段（ribosome footprints，RFPs），然后对这些被核糖体保护的22-35nt左右的RNA片段进行富集、深度测序、分析，以揭示核糖体的位置和密度。 通过Ribo-seq可获得全基因组水平的蛋白翻译情况，发现新蛋白/短肽。 同时，还可以和转录组数据联合计算RNA的翻译效率，或与蛋白组的数据联合分析瞬时翻译与蛋白累积的关系， …
We perform an initial PCR to determine the cycle at which it amplifies, and then perform a second PCR up to that cycle number. RNA-seq samples generally amplify at cycles 2-8; ribosome profiling samples generally amplify at cycles 6-12.
Ribo-seq文献大礼包（二）：Polysome Profiling、RNC-Seq、Ribo-Seq、Ribo …
2024年5月14日 · 由于 核糖体与mRNA的非共价结合， 核糖体新生链复合物 (RNC) 非常 脆弱，在细胞裂解后易发生解离或降解。 发展了几种重要和经典的方法来分析正在翻译mRNAs的不同特征： 多聚体分析 (polysome profiling) 、 正在翻译的全长mRNA分析 (RNC-seq) 、 正在翻译核糖体亲和纯化 (TRAP-seq) 和 核糖体分析 (Ribo-seq)。 这些方法的基本原理如图所示。 2.1.1. Polysome Profiling. 20世纪60年代，在蔗糖梯度超速离心的基础上发展了 Polysome Profiling。 核糖体是 …
Active Ribosome Profiling with RiboLace: Cell Reports
2018年10月23日 · Ribosome profiling, or Ribo-seq, is based on large-scale sequencing of RNA fragments protected from nuclease digestion by ribosomes. Thanks to its unique ability to provide positional information about ribosomes flowing along transcripts, this method can be used to shed light on mechanistic aspects of translation.