The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) finds regions of local similarity between sequences. The program compares nucleotide or protein sequences to sequence databases and calculates the statistical significance of matches.

Recurrence quantification analysis (RQA) is a method of nonlinear data analysis (cf. chaos theory) for the investigation of dynamical systems. It quantifies the number and duration of recurrences of a dynamical system presented by its phase space trajectory. [1]

PyRQA is a tool to conduct recurrence quantification analysis (RQA) and to create recurrence plots in a massively parallel manner using the OpenCL framework. It is designed to process very long time series consisting of hundreds of thousands of data points efficiently. PyRQA supports the computation of the following RQA measures:

递归 量化分析 （RQA）是用于分析和量化时间序列数据的工具，它不仅揭示了数据序列的复杂性，还能够帮助我们发现数据中的重复模式和结构。 RQA在数据科学领域发挥着至关重要的作用，尤其是在处理非线性动力学系统和复杂时间序列时，它提供了一种独特的视角来理解数据背后的行为模式和系统状态。 递归量化分析是一种利用系统自身输出的数据来构建递归图的分析方法。 递归图是一种描绘数据点如何随时间递归出现的图示。 RQA通过量化的度量，如递归率、确定性 …

Tools and tutorials to help with recurrence quantification analysis (RQA), cross-recurrence quantification analysis (CRQA), and detrended fluctuation analysis (DFA). Here are the tutorials that are currently available:

Calculate all RQA parameters of a recurrence matrix R. See the functions referred to below for the definition of the different parameters and the default values of the arguments.

BLAST是“局部相似性基本查询工具” (Basic Local Alignment Search Tool)的缩写，是由美国国立生物技术信息中心 (NCBI)开发的一个基于序列相似性的数据库搜索程序,是目前最常用的数据库搜索程序。 BLAST实际是综合在一起的一组工具的统称，它不仅可用于直接对核酸序列数据库和蛋白质序列数据库进行搜索，而且可以将带搜索的核酸序列翻译成蛋白质序列后再进行搜索，或反之，以提高搜索效率。 常用BLAST分类: 标准BLAST：Blastn、Blastp、Blastx、tBlastn、tBlastx. …

Seamlessly interfaces the Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) to search genetic sequence data bases. This work was partially supported by grant no. R21HG005912 from the National Human Genome Research Institute.

2023年10月9日 · tblastx: 先将待查询的核酸序列和核酸序列数据库中的核酸序列按六种可读框架翻译成蛋白质序列，然后再将两种翻译结果从蛋白质水平进行查询。 1，进入在线blast界面，可以选择blast特定的物种（如下）。 不同的blast程序上面已经有了介绍。 这里以常用的Blast 中 nucleotide blast 作为例子。 2，粘贴 fasta 格式的序列（可以是多条奥！ ）或使用Accession number（s）、gi（s）（注意仅使用数字，不加上标志符gi）。 选择一个要比对的数据库， …

2015年12月17日 · 〔摘 要〕按照行业标准YY/T0481-2004的规定，本文详细介绍了建立标准辐射质量RQA所需的3个 关键程序，然后以实例介绍了标准辐射质量RQA5的建立。