Recurrence quantification analysis (RQA) is a method of nonlinear data analysis (cf. chaos theory) for the investigation of dynamical systems. It quantifies the number and duration of recurrences of a dynamical system presented by its phase space trajectory. [1]

2015年3月25日 · Aiming to the dynamic nonlinearity of rotor-bearing system in the mechanical and fluid resonance states, a new method combining Recurrence Quantification Analysis (RQA) with optimal binary tree Support Vector Machine (SVM) is proposed for characterizing and identifying the resonance states.

2020年6月26日 · IQ-TREE支持针对DNA、protein、codon等大量的模型可供选择，但是通常情况下，我们不知道哪个模型最适合我们的数据，而调用软件内置 ModelFinder 确定最合适的模型。

Calculate all RQA parameters of a recurrence matrix R. See the functions referred to below for the definition of the different parameters and the default values of the arguments. Using this function is much more efficient than calling all individual functions one by one. Return.

Length of an entry in the RQAESRV array. Token that uniquely identifies the state of the system at the time (value in field RQAATIM) the current data was collected. This token is updated …

IQ-Tree是2014年新推出的一款基于最大似然法（ML）的建树软件，具有准确、快速、灵活等特点，特别适用于大数据的系统发育分析。 该软件的具体功能详见官方网站介绍（ http://www.iqtree.org/），本文不再赘述，下文…

2019年9月27日 · IQ-tree支持多种不同输入数据的替代模型选择，包括. 通过设置参数 -m MFP 使其自动测试并选择最优替代模型. 这个参数其实已经可以不用给了，上述说过，会默认执行。 example.phy.model 记录了所有模型的似然信息。 事实上，最优替代模型的信息会记录 example.phy.iqtree 中。 如果是完全相同的多序列比对结果，那么最优替代模型也是相同的。 如果并没有改变过，那么完全可以指定替代模型，比如已知最优替代模型为 TIM2+I+G。 那么可以 …

只是此处与Linear Regression直接求伪逆与Y的乘积，或者与通过梯度下降与反向传播迭代求解的Neural Network不同，Regression Tree通过以下算法最小化上式的Mean Square Error，具体方法会是这样的：

2024年5月6日 · R-tree是一种用于处理空间数据的自平衡搜索树结构，特别适合于存储和查询二维或更高维度的空间对象，如点、线段、矩形等。 它在地理信息系统、计算机图形学、数据库等领域有广泛应用。

刚好上上周在大乱斗的实战里打出过一次rqaa，这里面第二段素材就是 【提问：厄斐琉斯大乱斗要不要控刀？ -哔哩哔哩】 https://b23.tv/nHK3a09