5种方式美化你的单细胞umap散点图 - 腾讯云
2025年1月11日 · Nebulosa 是一个基于核密度估计可视化单细胞数据的 R 包，主要通过结合细胞之间的相似性来恢复丢失特征中的信号，从而实现细胞特征的“卷积”。 学习官网： …
实战探究五个参数对UMAP图可视化的影响 - 腾讯云
2024年3月25日 · 这篇推文的目的是探索一些重要参数对后续分群umap可视化的影响。 参数主要考虑：高变基因个数；pca维数；UMAP中的n_neighbors，min_dist和dims参数。 影响主要 …
Understanding UMAP - GitHub Pages
In this article, we'll take a look at the theory behind UMAP in order to better understand how the algorithm works, how to use it effectively, and how its performance compares with t-SNE. …
单细胞组学 | 第20期. 美无极限——卷起来的UMAP图美化方案
2024年4月30日 · 本系列推送旨在带领生信零基础的科研人一起入门单细胞（核）转录组数据分析。 CNS顶刊炫酷的UMAP图到底是怎么画的？ 作为单细胞分析的常规figure——UMAP层出不 …
umap调整及常见参数 - 知乎 - 知乎专栏
UMAP（Uniform Manifold Approximation and Projection）是一种广泛用于高维数据降维的算法，在单细胞分析中常用于可视化细胞的聚类和群体关系。 以下是 UMAP 的常见参数及调整建 …
scRNA分析|单细胞文献Fig1中的分组umap图和细胞比例柱形图
类似2021年CELL 文章Single-cell landscape of the ecosystem in early-relapse hepatocellular carcinoma，单细胞文献的Fig1一般会有细胞类型的全局umap图，分样本 和 分组的umap图 …
Python UMAP库：高效的降维与数据可视化 - CSDN博客
UMAP（Uniform Manifold Approximation and Projection）是一种先进的降维技术，能够高效地处理大规模数据，并生成高质量的低维表示。 本文将详细介绍UMAP库的功能、安装与配置、基 …
转录组不求人系列(四):UMAP分析及可视化 - 知乎
也许听到umap最多的是对单细胞数据的分析降维，类似于下图： 然而其他数据，像大样本的 转录组 在pca降维效果不好的时候，可以使用umap，毕竟现在转录非常便宜，随便测几十个样品 …
基于OmicVerse 的单细胞umap图绘制 - CSDN博客
2024年11月25日 · UMAPUniformManifoldAProjection）是一种用于降维的非线性技术，主要用于高维数据的可视化和探索 [1]。 它可以将高维 数据 嵌入到低维空间（通常是二维或三维）， …
umap，一个超强的 Python 库！ - CSDN博客
2024年1月27日 · UMAP（Uniform Manifold Approximation and Projection）是一种非线性降维技术，旨在将高维数据映射到低维空间，同时保留数据的局部结构。与传统的降维方法（ …
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