Scientific workflow engine designed for simplicity & scalability. Trivially transition between one off use cases to massive scale production environments

The Workflow Description Language (WDL) (pronounced as /hwɪdl/ or "whittle" with a 'd') is an open standard for describing data processing workflows using a human-readable/writeable syntax.

2019年6月24日 · WDL （一个workflow description language）+ Cromwell（an execution engine that can run WDL scripts）是目前可以更好使用GATK的一套工具。 这里学习wdl的快速入门教程。 WDL是一种流程编写语言，没有太多复杂的逻辑和语法，入门简单。

2024年8月30日 · WDL（Workflow Description Language）是一种用于定义数据处理工作流的语言，旨在帮助研究人员和开发人员描述和执行复杂的数据处理任务。 WDL主要用于生物信息学领域，但也适用于其他需要定义多步骤数据处理的领域。 WDL的设计目的是简单、易读、可扩展，并与各种执行引擎兼容，如Cromwell和MiniWDL。 WDL是一种强大且灵活的工作流描述语言，适用于各种复杂的数据处理任务。 通过定义任务和工作流，研究人员和开发人员可以轻松描述和 …

2020年9月4日 · Cromwell（an execution engine that can run WDL scripts）是基于java编写的可以很好地用来执行WDL语言的引擎工具。 WDL+Cromwell就是一套很好的分析流程解决方案。 WDL：整体是由一个workflow构成，一般写在一个后缀为“.wdl”的文件里面。

2022年5月17日 · WDL + Cromwell（an execution engine that can run WDL scripts）是目前可以更好使用GATK的一套工具。 这里学习 wdl 的快速入门教程。 WDL 是一种 流程 编写 语言 ，没有太多复杂的逻辑和语法，入门简单。

WDL是 Broad Institute 开发的“human readable and writable”定义组织任务与工作流的一种语言。从开发者及开发者赋予的名字中，我们就能看出WDL是一个面向生物信息/基因组学领域的专业的工具。

2021年3月23日 · 初步认识WDL，是 Workflow Description Language 的缩写，有时也写作 Workflow Definition Language ，是美国 Broad Institute 推出的工作流描述语言。 它很好的规范了目前串写流程的弊端，使得写出来的pipeline比较规范而且易于看懂。 此外它适合很多平台，移植性高，能出来大规模投递任务。 但是弊端就是不够灵活和中文学习资料很少。 对WDL语言进行解析是 Cromwell, 用java撰写的一个jar，它可以投递和监控任务，说白了它是把撰写好的WDL描 …

2021年8月21日 · cromwell 是一个面向科学工作流程的工作流管理系统，基于BSD 3-Clause license证书的开源软件，支持在三种平台上运行WDL: 本地机器、通过作业调度器(GridEngine，例如PBS , Slurm )访问的本地集群 和 **云平台 **(例如谷歌云或Amazon AWS） 。

1.4 Running WDL via a computing engine. In order to run a WDL workflow, we need a computing engine to execute it. The two most popular WDL executors are miniwdl and Cromwell. Both computing engines can run WDLs on multiple configurations: A local machine; A High Performance Computing (HPC) Cluster; A Cloud Computing backend (such as AWS/Terra ...