
质谱数据文件解析(一)—mzML格式 - 知乎 - 知乎专栏
具体的过程就是把大的蛋白质分子“掐断”成小的氨基酸离子条,然后质谱仪就可以测得很多的这些小离子的 质荷比 (m/z)形成实验谱图,再将实验谱图与现有的库谱图比对就可以确认实验谱图代表的蛋白质种类是不是库谱图对应的蛋白质,从而实现样品蛋白质成分鉴定。 可见,这种方法是由小见大,从微知著的间接思路,这就叫做“button-to-top”,从下往上递推。 (希望以后可以直接鉴定蛋白质而不需要打碎,省去这么多弯弯绕。 在上述过程中,质谱仪的输出数据格式是各个 …
代谢组学-质谱数据格式 - 知乎 - 知乎专栏
简介:mzML 是一个标准化的格式,设计用于包含几乎所有类型的质谱数据,包括但不限于 LC-MS、GC-MS、MS/MS。 与早期的 mzData 和 mzXML 等格式相比,mzML 支持更复杂的实验设计和更丰富的元数据。 定位:原始数据的流通格式。 数据结构:mzML 文件结构遵循 XML标准,主要由以下部分组成: (1)文件头(Header):包括版本信息和命名空间声明。 (2)元数据(Metadata):提供实验的详细描述,包括样品信息、仪器配置、数据处理方法等。 (3)数 …
mzML—a Community Standard for Mass Spectrometry Data
2011年1月1日 · The resulting standard data format, mzML, is a well tested open-source format for mass spectrometer output files that can be readily utilized by the community and easily adapted for incremental advances in mass spectrometry technology. Mass spectrometry (MS) 1 has recently emerged as a major discovery tool in the life sciences (1).
深扒质谱数据格式标准化,它的来历可不简单! - 知乎
一种是由系统生物学研究所 (Institute for Systems Biology, ISB)开发的 mzXML 格式,主要是为了简化数据处理软件。 这两种格式都被广泛使用,但是对于本质上相同的信息,使用两种格式会造成不必要的混淆,并增加软件开发复杂性。 2006年春季,各个供应商在PSI会议上表达了他们对支持两种格式的不满,最终在PSI的倡议与支持下,2008年, 第三种新的数据标准格式 应运而生,它就是 mzML 1.0.0。 图1:mzML诞生史,引用文献 Eric W. Deutsch. Mass Spectrometer Output …
mzML Files — pyOpenMS 3.3.0dev documentation - Read the Docs
Specifically, we will look at mzML stores raw spectral data and how this data is encoded in the XML format. The mzML standard is developed by the HUPO-PSI committee and can be read on the official mzML website. It describes how to store the meta data and the raw data for spectra and chromatograms.
Welcome to the mzmine documentation! - mzio
mzmine is an open-source and platform-independent software for mass spectrometry (MS) data processing and visualization. The workflow is optimised to allow processing of large-scale mass spectrometry studies. mzmine supports multiple raw data formats, including open formats such as mzML and several vendor-specific file types.
mzmine - mzio
Deep dive into your imaging raw data. You have access to each pixel’s raw data. Quality control tools including Kendrick Mass Defect (KMD) plots, equivalent carbon number plots, and annotated MS2 spectra. Your browser does not support the video …
MZmine 2-代谢组学数据处理软件教程 - 哔哩哔哩
软件下载地址: Software download https://link.zhihu.com/?target=https%3A//github.com/mzmine/mzmine2/releases. 该软件支持多种电脑系统,下载解压即可。 The software supports a variety of computer systems, download decompression can. 软件运行:在安装包内找到下图标记的程序,双击即可运行。 Software run: in the installation package to find the following icon marked the program, double-click can run. …
Fast and Efficient XML Data Access for Next-Generation Mass
2015年4月30日 · In mass spectrometry-based proteomics, XML formats such as mzML and mzXML provide an open and standardized way to store and exchange the raw data (spectra and chromatograms) of mass spectrometric experiments.
基于马赫曾德尔调制器的外调制技术 - CSDN博客
2024年8月29日 · 图2是基于铌酸锂的马赫曾德尔调制器(LN-MZM)的结构图,它由两个Y形波导结构构成,在理想的情况下,输入光功率首先在第一个Y形波导处,即A点,被平均分配到两个分支上,然后经过上下两路光波导的传输后,在第二个Y形波导处干涉,即B点,其中B点输出光波的幅度跟由两路光波导传输造成的光程差有关。 图2 LN-MZM结构图. 所以可以通过改变外加驱动电压的大小,改变两路光波导的折射率,使经过上下两路光波导传输后的两束光波在第二个Y分支 …